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Nature：測序揭示轉(zhuǎn)移性腫瘤有何大不同
時(shí)間：2017-08-07 11:28:44 來源：生物通 點(diǎn)擊：
美國密歇根大學(xué)的研究人員近期對(duì)500例的轉(zhuǎn)移性腫瘤開展全外顯子組和全轉(zhuǎn)錄組測序，發(fā)現(xiàn)它們帶有的突變比原發(fā)性腫瘤更多。這項(xiàng)成果于8月2日發(fā)布在《Nature》雜志上。
同時(shí)，研究人員還發(fā)現(xiàn)，相當(dāng)一部分癌癥轉(zhuǎn)移的患者帶有生殖系突變，這增加了他們的癌癥風(fēng)險(xiǎn)。此外，他們指出，轉(zhuǎn)移性腫瘤可根據(jù)其mRNA表達(dá)譜分成兩組，而這些亞型似乎與腫瘤對(duì)治療的反應(yīng)有關(guān)。
這篇文章的通訊作者、密歇根大學(xué)的Arul Chinnaiyan表示：“我們的研究結(jié)果強(qiáng)調(diào)了對(duì)轉(zhuǎn)移性腫瘤進(jìn)行新鮮活檢的重要性。在轉(zhuǎn)移和治療的過程中，腫瘤也在不斷發(fā)展。我們需要對(duì)轉(zhuǎn)移性腫瘤進(jìn)行活檢，然后提出治療方法，而不是使用原發(fā)性腫瘤的存檔組織。”
研究團(tuán)隊(duì)對(duì)500名轉(zhuǎn)移性癌癥患者的活檢樣本和生殖系DNA進(jìn)行測序，這些樣本代表20種癌癥，最常見的是轉(zhuǎn)移性前列腺癌、乳腺癌和軟組織肉瘤。最頻繁的轉(zhuǎn)移灶是肝、淋巴結(jié)、肺和骨。
平均而言，研究人員在每位患者中觀察到119個(gè)體細(xì)胞突變，與大多數(shù)癌癥的原發(fā)性腫瘤相比，突變的數(shù)量明顯增加。他們將這種增加歸因于癌癥的侵襲性，累積突變的時(shí)間延長，以及治療的影響。
不過，盡管突變的數(shù)量增加，但研究人員發(fā)現(xiàn)，只有少數(shù)基因以高頻率突變。大多數(shù)時(shí)候，這些突變集中在抑癌基因TP53、CDKN2A、PTEN和RB1，或癌基因PIK3CA、AR和KRAS。
Chinnaiyan及其同事也調(diào)查了這些患者的致病性生殖系突變。他們發(fā)現(xiàn)，12%的患者帶有可能致病的遺傳突變。最終，他們定位到63個(gè)可能致病的生殖系突變。三分之二的突變位于參與DNA修復(fù)的基因，如MUTYH、BRCA2、CHEK2和BRCA1。
他們將這些突變的頻率與外顯子整合聯(lián)盟（ExAC）的數(shù)據(jù)集進(jìn)行比較，發(fā)現(xiàn)此次分析的隊(duì)列人群更有可能攜帶致病的生殖系突變。
與此同時(shí)，研究人員也分析了這些轉(zhuǎn)移性癌癥患者的轉(zhuǎn)錄組。他們發(fā)現(xiàn)，與癌癥相關(guān)的轉(zhuǎn)錄程序增加。與正常組織相比，轉(zhuǎn)移性腫瘤的增殖、應(yīng)激反應(yīng)和代謝增加。同時(shí)，他們將腫瘤分成兩個(gè)亞型，一個(gè)是與炎癥相關(guān)，另一個(gè)與增殖相關(guān)。
“并非所有的轉(zhuǎn)移都是相同的，”Chinnaiyan談道。“不同通路的推動(dòng)，讓它們彼此完全不同，有些是高度增殖，有些則傾向于分化。這種互相排斥的現(xiàn)象是一個(gè)新發(fā)現(xiàn)，有望指導(dǎo)我們開發(fā)出新型的療法。”
