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面對(duì)復(fù)雜多變的癌癥基因檢測(cè)市場(chǎng),臨床學(xué)家該何去何從?
時(shí)間:2017-06-15 09:46:28 來(lái)源:測(cè)序中國(guó) 點(diǎn)擊:

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在剛剛結(jié)束不久的ASCO年會(huì)上,眾多科研機(jī)構(gòu)及企業(yè)發(fā)布了眾多令人欣喜的抗癌新成果。作為全球性的學(xué)術(shù)交流盛會(huì),ASCO 代表了臨床腫瘤診療研究的最高水平,在本次大會(huì)上,大部分參會(huì)者及演講嘉賓都對(duì)分子檢測(cè)和精準(zhǔn)醫(yī)療表示了認(rèn)可,他們認(rèn)為,精準(zhǔn)醫(yī)療已在癌癥醫(yī)療領(lǐng)域的實(shí)踐中達(dá)到了一個(gè)嶄新的成熟階段。

但是,隨著基因檢測(cè)在臨床及商業(yè)應(yīng)用中日益復(fù)雜的形勢(shì),對(duì)于臨床醫(yī)生,這一嶄新的領(lǐng)域仍然是一個(gè)巨大挑戰(zhàn),眾多腫瘤學(xué)家也在ASCO的會(huì)議中討論了當(dāng)前精準(zhǔn)醫(yī)療的效用及挑戰(zhàn)。

癌癥基因組測(cè)序:臨床醫(yī)生該如何使用?

腫瘤學(xué)家Lee Schwartzburg博士談到:“目前,我們正處于癌癥基因組測(cè)序成為常規(guī)診斷方法的過渡階段,但在現(xiàn)在及將來(lái),我們所面臨的主要問題是如何使用這些技術(shù)。”

Schwartzburg還表示,目前腫瘤學(xué)領(lǐng)域已經(jīng)出現(xiàn)了兩種觀點(diǎn):一方面,醫(yī)生們認(rèn)為基因檢測(cè)非常重要,也相信該技術(shù)會(huì)成為一種標(biāo)準(zhǔn)的醫(yī)療手段,至少在某些領(lǐng)域會(huì)實(shí)現(xiàn);但另一方面,在個(gè)體水平上,醫(yī)生仍然不知道他們?cè)撛谑裁磿r(shí)候、以何種方式對(duì)病人進(jìn)行基因檢測(cè)。

舉個(gè)例子, Medscape網(wǎng)站上個(gè)月對(duì)132名腫瘤學(xué)家進(jìn)行了一項(xiàng)調(diào)查。結(jié)果顯示,雖然70%的腫瘤學(xué)家認(rèn)為基因組檢測(cè)是癌癥領(lǐng)域的重要突破,但是僅有30%的受訪者表示,在選擇基因組檢測(cè)時(shí)從相關(guān)機(jī)構(gòu)獲得了指導(dǎo)。

雖然大部分受調(diào)查者表示,在近一周或一個(gè)月內(nèi)對(duì)病人使用過基因組檢測(cè),但大部分基因檢測(cè)是在標(biāo)準(zhǔn)治療方法不可行或病情惡化以及臨床試驗(yàn)中進(jìn)行的;此外,很多腫瘤學(xué)家還表示他們并不清楚應(yīng)該在什么情況下進(jìn)行這種檢測(cè);同時(shí),受訪者還對(duì)檢測(cè)給病人的帶來(lái)的收益和意義有著強(qiáng)烈的分歧,尤其是對(duì)較為罕見的突變檢測(cè)。

肺癌分子檢測(cè)帶來(lái)啟示

但對(duì)腫瘤學(xué)的某些領(lǐng)域而言,情況會(huì)好很多。萊文癌癥研究所的腫瘤學(xué)家Edward Kim表示,例如肺癌的分子檢測(cè)就已經(jīng)被作為一種關(guān)鍵的常規(guī)檢測(cè)。

Edward Kim在會(huì)議中談道:“分子檢測(cè)對(duì)診斷和階段性的檢查是必不可少。這是必須進(jìn)行的檢測(cè),而且應(yīng)該成為初期診斷的基礎(chǔ)組成部分。”

換言之,新確診的肺癌患者不應(yīng)該在沒有進(jìn)行基因組檢測(cè)的情況下直接進(jìn)行化療。因?yàn)榛蚪M檢測(cè)結(jié)果可能會(huì)顯示,一些病人并不適合某種基因靶向或免疫治療藥物。

但美國(guó)達(dá)納-法伯癌癥研究所腫瘤學(xué)家Deborah Schrag也表示,雖然ASCO的指南和美國(guó)腫瘤治療指南推薦在初始治療前進(jìn)行EGFR基因和ALK基因的生物標(biāo)志物檢測(cè),但在社區(qū)機(jī)構(gòu)中,40%的患者并沒有進(jìn)行EGFR檢測(cè),50%的患者也沒有接受ALK基因的檢測(cè)。

此外,即使對(duì)于EGFR和ALK這些有著“頂級(jí)標(biāo)準(zhǔn)”的基因測(cè)試,臨床醫(yī)生仍然不知道應(yīng)該選擇哪種檢測(cè)方法。例如,面對(duì)最新出現(xiàn)的血液型檢測(cè)或液體活檢技術(shù),以及EGFR耐藥性突變,這些都成為了肺癌醫(yī)生面臨的新挑戰(zhàn)。

去年六月,羅氏公司基于PCR的 Cobas EGFR Mutation Test v2已經(jīng)獲批作為基因泰克公司Tarceva (erlotinib)藥物的伴隨診斷,F(xiàn)DA在九月份擴(kuò)大了檢測(cè)的適用范圍,增加了一項(xiàng)作為非小型細(xì)胞肺癌患者在接受阿斯利康公司的Tagrisso (osimertinib)藥物治療時(shí)的伴隨診斷。

但是其他公司為了相同的目的也提供了實(shí)驗(yàn)室自建試劑方法(LDTs),且有些方法的敏感度更高。

Kim表示,在萊文癌癥研究所內(nèi),肺癌領(lǐng)域的從業(yè)醫(yī)生遵守了一種關(guān)于明確定義的方法,以判斷進(jìn)行基因檢測(cè)的時(shí)間和方式。例如,研究所會(huì)將組織樣本會(huì)送去Caris Life Sciences公司;對(duì)于最近興起的血液型檢測(cè)方法(液態(tài)活檢技術(shù)),研究所則選擇了Inivata公司。

初期診斷之外的情況則更為復(fù)雜,甚至可以用“一片泥濘”形容,而實(shí)踐的標(biāo)準(zhǔn)化可以說幾乎是無(wú)法實(shí)現(xiàn)的。

Schrag舉了一個(gè)例子,一名中年男性患者患有局部晚期而且不可切除的胰腺癌。“胰腺癌并不是精準(zhǔn)醫(yī)療應(yīng)用的典型代表,而且也不是任何技術(shù)應(yīng)用的典型代表。”當(dāng)放療和化療都無(wú)法使其腫瘤縮小到可以進(jìn)行手術(shù)切除后,這名患者向一家商業(yè)實(shí)驗(yàn)室尋求了全面的基因組檢測(cè),并最終檢測(cè)到ALK基因變異。之后患者回到腫瘤醫(yī)生那里,并要求服用未得到臨床認(rèn)可的藥物克唑替尼。

Schrag在會(huì)上問道:“你會(huì)怎么做?咨詢腫瘤委員還是查找文獻(xiàn)?或進(jìn)行臨床試驗(yàn)?還是直接開藥?……”

她補(bǔ)充說,文獻(xiàn)中積極的報(bào)道可以幫助我們對(duì)未得到臨床認(rèn)可的藥物進(jìn)行用藥決策。但是,懷疑者也可能會(huì)說,此前曾受到過這些信息的誤導(dǎo)。例如,威羅非尼對(duì)攜帶有BRAF突變的黑色素瘤有效,但是在攜帶有BRAF突變的結(jié)直腸癌中卻沒有作用。”

Schrag強(qiáng)調(diào):“這是都是真實(shí)且日益普遍的現(xiàn)象,這代表著我們?nèi)粘5哪[瘤治療實(shí)踐。”

效用及經(jīng)濟(jì)問題日漸突出

另一方面,商業(yè)檢測(cè)的復(fù)雜性日益增長(zhǎng),也帶來(lái)了效用和經(jīng)濟(jì)方面的問題,但腫瘤領(lǐng)域還不具有同等的處理能力。

Schwartzburg認(rèn)為,測(cè)序的成本至今已經(jīng)下降了,放棄綜合panel而選擇單基因測(cè)試的經(jīng)濟(jì)學(xué)論據(jù)很少,因?yàn)殛幮越Y(jié)果進(jìn)一步測(cè)試的成本快速超過了從一開始就選擇綜合panel的價(jià)格。

但是Schrag也表示,費(fèi)用的效用并不能完全按照這樣的推理思路,因此考慮使用綜合的還是范圍較窄的檢測(cè)對(duì)醫(yī)生來(lái)說仍然是不小的挑戰(zhàn)。

在會(huì)議最后的問答環(huán)節(jié)中,提問者主要關(guān)注的問題是目前行業(yè)缺乏一致標(biāo)準(zhǔn)或統(tǒng)一性,因?yàn)槭袌?chǎng)上有太多不同的綜合性測(cè)序產(chǎn)品可以選擇。

Kim對(duì)此表示贊同:“精準(zhǔn)醫(yī)療帶來(lái)的改變的確是發(fā)人深省的問題,而且基因panel和綜合性檢測(cè)的數(shù)量確實(shí)多到令人生畏。”

Schwartzburg也表示,參會(huì)者應(yīng)該意識(shí)到,基因組檢測(cè)與傳統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)室分析是不同的。而對(duì)于傳統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè),在不同供應(yīng)商間進(jìn)行同種檢測(cè)可以預(yù)期得到相同的結(jié)果。腫瘤學(xué)家應(yīng)該主動(dòng)去解讀綜合性panel的報(bào)告結(jié)果,然后評(píng)估測(cè)序深度等信息,這可能是不同公司間對(duì)于同組基因檢測(cè)報(bào)告結(jié)果出現(xiàn)差異的主要原因。

Schwartzburg強(qiáng)調(diào):“你需要首先了解檢測(cè)的特性,確保能夠理解所獲得的信息。”

此外,差異的來(lái)源還包括數(shù)據(jù)的解讀和變異識(shí)別。他表示,美國(guó)分子病理學(xué)等組織機(jī)構(gòu)也正在尋找解決方法。

Schrag談道,臨床腫瘤機(jī)構(gòu)真正需要的是明確的數(shù)據(jù),能夠用于證明接受全面基因組檢測(cè)并進(jìn)行精準(zhǔn)治療的患者,其預(yù)后優(yōu)于未獲得這些信息的患者。

可惜得是,目前這一領(lǐng)域還沒有答案。這也許解釋了人們對(duì)于基因組醫(yī)學(xué)的熱情和對(duì)其價(jià)值的懷疑。

精準(zhǔn)醫(yī)療“新趨勢(shì)”下的新挑戰(zhàn)

演講者們最后討論了該領(lǐng)域中近期的一些舉措,可能會(huì)加劇醫(yī)生們的困難,尤其是最近FDA批準(zhǔn)的不區(qū)分腫瘤來(lái)源的抗癌療法。5月23日,美國(guó)FDA批準(zhǔn)了默沙東公司的PD-1抗體Keytruda 用于治療攜帶一種特定基因特征的任何一種實(shí)體瘤。這是美國(guó)FDA批準(zhǔn)的首款不依據(jù)腫瘤來(lái)源,而是依據(jù)生物標(biāo)志物進(jìn)行區(qū)分的抗腫瘤療法。

從ASCO展示的數(shù)據(jù)來(lái)看,類似的癌癥位點(diǎn)未知的檢測(cè)可能會(huì)持續(xù)增多并獲批,例如在TRK基因融合陽(yáng)性腫瘤檢測(cè)的參與者中,有四分之三都對(duì)Loxo Oncology公司的藥物larotrectinib具有反應(yīng),無(wú)論是哪種癌癥類型。

Schrag將Keytruda的例子稱作一個(gè)分水嶺,但是她提醒道,這也無(wú)疑為臨床醫(yī)生帶來(lái)了另一些挑戰(zhàn)。她在會(huì)議中表示,“我相信很多人都接到過來(lái)自患者的電話,詢問他們的腫瘤是否具有高度微衛(wèi)星不穩(wěn)定性。”

她提出,醫(yī)生可能會(huì)疑惑選擇哪種檢測(cè)。FDA雖然批準(zhǔn)了Keytruda,但卻沒有專門的伴隨診斷檢測(cè)。關(guān)于檢測(cè)人群則是一個(gè)開放的問題。弄清楚某種檢測(cè)的必要性需要了解不同癌癥類型的MSI頻率,同時(shí)Schrag也談到,目前還沒有機(jī)構(gòu)可以對(duì)此進(jìn)行快速檢測(cè)。

參考資料:

Oncologists Discuss Practicalities, Challenges in Navigating Evolving Genomic Testing Market

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