人巨細胞病毒蛋白質組測序完成
時間：2012-11-26 13:23:37 來源：三濟生物 點擊：
來自：生物無憂
美國和德國研究人員進行的一項新研究增加了我們對人巨細胞病毒(HCMV)以及它對所感染寄主細胞的操縱機制的理解。
HCMV是一種非常常見的皰疹病毒,它的感染率為50-100%,其感染后通常不會產(chǎn)生疾病表征,并可能會潛伏多年。HCMV感染在發(fā)展中國家比在發(fā)達國家更常見.該病毒可以導致新生嬰兒先天畸型,并給免疫力低下的患者帶來嚴重的甚至致命的影響。另外,還有研究顯示該病毒可能在癌癥的發(fā)展過程中發(fā)揮一定作用。
美國舊金山加利福尼亞大學Jonathan Weissman實驗室的Noam Stern-Ginossar領導了這一研究,來自美國和德國的研究人員組成的團隊觀察了這一病毒的蛋白組,即調查了所有表達的蛋白.研究人員認為,基因組編碼的潛在蛋白質圖譜很多是基于計算機模型的預測,這是很不完全的。
在20年前,HCMV的基因組被首次測序成功,之后又有另外16種病毒株被測序。HCMV是一個特別大的病毒基因組,大約有240000個堿基對。
該研究小組對人類成纖維細胞被HCMV感染后的細胞核糖體位置進行了蛋白質圖譜的測定。核糖體是細胞內負責蛋白生產(chǎn)的細胞器。之后,研究人員用質譜的方法確定了這些預測蛋白是否存在。這一研究確定了之前尚未確定的編碼于基因組中的上百種蛋白。
編碼蛋白的DNA片段被稱為“開放閱讀框”。之前的研究根據(jù)HCMV基因組的序列,已經(jīng)預測出了大約200種可能存在的閱讀框.在這一新研究中,研究小組發(fā)現(xiàn)了在預測閱讀框中的一些編碼極短蛋白序列（由100個甚至更少的氨基酸組成）的開放閱讀框。他們還發(fā)現(xiàn),一些開放閱讀框是位于另一些閱讀框內部的。這一蛋白組的復雜性令他們非常驚訝和意外。
解病毒基因組表達的蛋白質情況能夠幫助我們確定這些病毒是如何影響寄主細胞的,并幫助我們找出抑制它們感染寄主細胞的方法。
這篇文章發(fā)表在Science雜志上,研究小組提到:他們所用到的核糖體基因組圖譜以及質譜分析相結合的方法還可以用于確定其它復雜的病毒蛋白組。
美國和德國研究人員進行的一項新研究增加了我們對人巨細胞病毒(HCMV)以及它對所感染寄主細胞的操縱機制的理解。
HCMV是一種非常常見的皰疹病毒,它的感染率為50-100%,其感染后通常不會產(chǎn)生疾病表征,并可能會潛伏多年。HCMV感染在發(fā)展中國家比在發(fā)達國家更常見.該病毒可以導致新生嬰兒先天畸型,并給免疫力低下的患者帶來嚴重的甚至致命的影響。另外,還有研究顯示該病毒可能在癌癥的發(fā)展過程中發(fā)揮一定作用。
美國舊金山加利福尼亞大學Jonathan Weissman實驗室的Noam Stern-Ginossar領導了這一研究,來自美國和德國的研究人員組成的團隊觀察了這一病毒的蛋白組,即調查了所有表達的蛋白.研究人員認為,基因組編碼的潛在蛋白質圖譜很多是基于計算機模型的預測,這是很不完全的。
在20年前,HCMV的基因組被首次測序成功,之后又有另外16種病毒株被測序。HCMV是一個特別大的病毒基因組,大約有240000個堿基對。
該研究小組對人類成纖維細胞被HCMV感染后的細胞核糖體位置進行了蛋白質圖譜的測定。核糖體是細胞內負責蛋白生產(chǎn)的細胞器。之后,研究人員用質譜的方法確定了這些預測蛋白是否存在。這一研究確定了之前尚未確定的編碼于基因組中的上百種蛋白。
編碼蛋白的DNA片段被稱為“開放閱讀框”。之前的研究根據(jù)HCMV基因組的序列,已經(jīng)預測出了大約200種可能存在的閱讀框.在這一新研究中,研究小組發(fā)現(xiàn)了在預測閱讀框中的一些編碼極短蛋白序列（由100個甚至更少的氨基酸組成）的開放閱讀框。他們還發(fā)現(xiàn),一些開放閱讀框是位于另一些閱讀框內部的。這一蛋白組的復雜性令他們非常驚訝和意外。
解病毒基因組表達的蛋白質情況能夠幫助我們確定這些病毒是如何影響寄主細胞的,并幫助我們找出抑制它們感染寄主細胞的方法。
這篇文章發(fā)表在Science雜志上,研究小組提到:他們所用到的核糖體基因組圖譜以及質譜分析相結合的方法還可以用于確定其它復雜的病毒蛋白組。
